MicrobeVision - forenklet metode for uttak, forsendelse og prosessering av prøver til mikrobiologi

Bakgrunn

Tradisjonell metodikk for uttak av prøver til mikrobiologi baserer seg på utstryk på egnet vekstmedium (agarskål) fra nyre og/eller sår, eventuelt andre typer vev. Vi har sett flere utfordringer med denne metodikken som kan påvirke kvaliteten til mikrobiologianalysene. Eksempelvis brukes det gamle agarskåler, feil type agar, manglende fortynning av utstryk og for lang inkubasjonstid. Dette kan hemme vekst av aktuelle bakterier eller føre til overvekst av miljøbakterier, som i verste fall kan skjule de bakteriene man ønsker å påvise.

Fremgangsmåte

MicrobeVision er et rør med transportmedium, som tar vare på bakteriene i vevet ved transport inn til laboratoriet. En liten bit vev legges direkte på transportmediet og sendes til laboratoriet uten videre arbeid i felt. Prøver til mikrobiologi blir dermed like enkelt som til RT-PCR. Ved ankomst til laboratoriet sås prøven ut på de aktuelle agarskålene i ulike fortynninger. MicrobeVision inneholder ulike salter som ivaretar levedyktigheten til bakterier, både fra sjø-, brakk- og ferskvann. Dermed slipper man å ha agarskåler i felt og man sikrer bakteriene god overlevelse i transporten. Se uttaksveileder her>

Denne metoden forenkler prøvetakingen, men også forsendelsen, da rørene tar mindre plass og vil ikke knuse slik som agarskåler ofte gjør. MicrobeVision er merket med holdbarhetsdato og bør oppbevares kjølig.

MicrobeVision kan benyttes til tradisjonelle vev som hud, nyre og gjeller, men åpner også opp for å kunne utføre mikrobiologiske analyser av vev som det er mer krevende å gjøre tradisjonelle utstryk fra, som yngel og rognkorn, samt levendefôr som Artemia. Metoden kan benyttes for alle typer vev, fra alle typer fisk, både kaldtvanns- og varmtvannsarter, marine og ferskvann.

Som for utstryk på agar, er det også for MicrobeVision viktig at prøvene oppbevares kjølig etter prøveuttak og under forsendelse. Det er viktig at prøvene ikke fryses, da dette vil svekke bakteriene og de vil ikke være dyrkbare. Prøvene må sendes så raskt som mulig(ekspress over natt), slik at de er på laboratoriet innen 48-72 timer etter prøveuttak .

Ved mottak av prøvene vil disse bli prosessert etter standardiserte protokoller og satt opp på egnet vekstmedium, med påfølgende inkubering og videre analyser. MicrobeVision er en robust metode for mikrobiologianalyser med en standardisering av utstryk, videre muliggjør oppsettet også en kvantifisering av bakterier fra prøvemateriale.